Il Palazzo dei Musei è un luogo denso di storia, in cui Arte e Natura convivono in un dialogo continuo.
La Pinacoteca, nata sul finire dell’Ottocento, racconta la ricchezza della tradizione artistica valsesiana, alimentata nei secoli dal prestigioso cantiere del Sacro Monte di Varallo, di cui il museo conserva alcune tra le più antiche testimonianze scultoree e pittoriche.Il percorso espositivo si snoda dal Quattrocento al Novecento seguendo il corso del tempo: dai capolavori di Gaudenzio Ferrari e Tanzio da Varallo, artisti di statura internazionale, alle collezioni di Palazzo D’Adda, influente famiglia milanese giunta a Varallo nella metà del Cinquecento.Il racconto prosegue tra Sette e Ottocento, periodo di grande fervore artistico in Valsesia, testimoniato da generazioni di artisti formatisi nelle Scuole varallesi, la più antica Scuola di Disegno e quella di intaglio ligneo fondata dal marchese Carlo Tancredi Falletti di Barolo.
Arricchiscono il patrimonio della Pinacoteca due importanti collezioni private:

• la raccolta Remogna, con opere di Moncalvo, Camillo Procaccini e Giambettino Cignaroli;
• la collezione di maioliche Francesco Franchi, composta da circa duecento pezzi che raccontano l’evoluzione dell’arte ceramica in Italia dal Trecento al Settecento attraverso le più prestigiose manifatture.

Il Museo di Storia Naturale, inaugurato nel 1867, porta il nome del suo fondatore, il sacerdote valsesiano Pietro Calderini. Nato come luogo di istruzione, con materiali naturalistici concepiti come strumenti didattici per le Scuole Tecniche, diventa nel tempo il fulcro degli studi scientifici in Valsesia. Alle collezioni scientifiche si affiancano progressivamente raccolte archeologiche e demoetnoantropologiche, trasformando il museo originario in una vera e propria Wunderkammer.
Nel 2017, in occasione dei 150 anni dalla fondazione, è stato riaperto al pubblico il nuovo salone dedicato alle scienze naturali: un viaggio alla scoperta della Terra, dai minerali alle rocce, fino alle testimonianze della vita nel passato – i fossili – e al percorso evolutivo del regno animale. Il Museo fa parte della rete MUVV – Musei di Vercelli e Varallo.
A partire dalla fine del 2025, il Palazzo dei Musei ospita I disegni della Pinacoteca di Varallo, un nuovo spazio permanente dedicato alla raccolta grafica del museo, composta da oltre duemila fogli databili tra il XVI e il XX secolo. L’iniziativa è finanziata da Fondazione Cariplo nell’ambito del progetto Apriti Museo e realizzata con il sostegno del Consorzio Monterosa Valsesia.